Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRSF5Q13243 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRSF5Q13243 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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