Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RPA4Q13156 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RPA4Q13156 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms