Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PTPN13Q12923 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PTPN13Q12923 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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