Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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GRIN2AQ12879 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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GRIN2AQ12879 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN2AQ12879 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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