Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CNTN1Q12860 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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