Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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KCNH2Q12809 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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KCNH2Q12809 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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KCNH2Q12809 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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KCNH2Q12809 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNH2Q12809 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNH2Q12809 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNH2Q12809 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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