Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TWF1Q12792 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TWF1Q12792 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TWF1Q12792 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TWF1Q12792 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TWF1Q12792 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TWF1Q12792 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TWF1Q12792 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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