Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms