Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GOLGA3Q08378 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA3Q08378 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms