Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TGM3Q08188 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms