Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK18Q07002 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms