Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX4Q06945 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX4Q06945 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms