Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CHRNEQ04844 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms