Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCNT1Q02742 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms