Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SPIBQ01892 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SPIBQ01892 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms