Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
E2F1Q01094 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms