Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP2C1P98194 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP2C1P98194 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms