Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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FAM3AP98173 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
FAM3AP98173 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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