Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SKOR1P84550 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SKOR1P84550 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms