Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
H3F3AP84243 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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H3F3AP84243 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
H3F3AP84243 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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