Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ERVS71-1P61550 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms