Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ABCE1P61221 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ABCE1P61221 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ABCE1P61221 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ABCE1P61221 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ABCE1P61221 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms