Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
UBE2NP61088 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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