Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVPABLB-1P60509 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms