Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
POLE2P56282 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
POLE2P56282 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms