Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
DAP3P51398 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms