Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA3P35244 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms