Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LSP1P33241 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LSP1P33241 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms