Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARID4AP29374 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms