Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EPHB2P29323 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms