Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms