Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD10P28358 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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HOXD10P28358 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXD10P28358 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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