Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLD1P28340 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
POLD1P28340 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms