Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PLNP26678 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PLNP26678 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PLNP26678 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms