Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA6P23229 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms