Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TAF1P21675 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms