Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CXCL3P19876 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CXCL3P19876 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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CXCL3P19876 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CXCL3P19876 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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