Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPRAP18433 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPRAP18433 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PTPRAP18433 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PTPRAP18433 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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