Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMD1P17707 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMD1P17707 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms