Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HMGA1P17096 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms