Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDGFRAP16234 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PDGFRAP16234 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms