Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-EP13747 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms