Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RLBP1P12271 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RLBP1P12271 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms