Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GLI3P10071 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms