Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF1P05230 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FGF1P05230 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms