Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HLA-DQB1P01920 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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