Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLSTN1O94985 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms