Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UBXN7O94888 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms