Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SIN3BO75182 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms