Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOC4-APOC2K7ER74 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms